יונתן כהן השלים את העברתו ממכבי תל אביב לקבוצת פיזה לאחר ששחקן ההתקפה בן ה-25 עבר בהצלחה את הבדיקות הרפואיות וחתם על חוזה בקבוצה האיטלקית.

מנכ"לית מכבי תל אביב שרון תמם, אמרה לאתר הרשמי לאחר השלמת עסקת המכירה: "יונתן גדל והתפתח במכבי תל אביב והפך לשחקן התקפה איכותי שהוכיח את היכולות שלו במועדון. אנו מאחלים לו בהצלחה בדרכו החדשה".
 
כהן, תוצר מחלקת הנוער של המועדון, כבש 41 שערים ב-111 הופעות בכל המסגרות בקבוצה הבוגרת במדיה זכה ב-7 תארים: 2 אליפויות (2018/19 ו-2019/20), גביע המדינה (2020/21), 2 גביעי טוטו (2019/20 ו-2020/21), ו-2 גביעי סופר-קאפ (2019/20 ו-2020/21). במפעלים האירופים כבש כהן במדי מכבי 4 שערים ב-17 הופעות והעפיל עם הקבוצה בעונת 2020/21 לשלב 32 האחרונות בליגה האירופית.